資源環(huán)境專項審計的對象主要是各級政府中承擔自然資源管理和生態(tài)環(huán)境保護的自然資源(含林草)、生態(tài)環(huán)境、水利、住房城鄉(xiāng)建設、海洋、農(nóng)業(yè)農(nóng)村等行政主管部門和財政、發(fā)展改革等部門，以及使用資源環(huán)境相關財政資金，從事資源勘查、開發(fā)、利用、保護或會對生態(tài)環(huán)境產(chǎn)生直接影響的企事業(yè)單位。

資源環(huán)境專項審計的主要內(nèi)容是：(1)生態(tài)文明領域重大決策部署、資源開發(fā)利用和生態(tài)環(huán)境保護重大事項審批以及規(guī)劃(計劃)的落實情況;(2)土地、水、森林、草原、礦產(chǎn)、海洋等自然資源資產(chǎn)的管理開發(fā)利用情況;(3)大氣、水、土壤等環(huán)境保護和環(huán)境改善情況;(4)森林、草原、荒漠、河流、湖泊、濕地、海洋等生態(tài)系統(tǒng)的保護和修復情況;(5)各地區(qū)、相關部門遵守自然資源資產(chǎn)管理和生態(tài)環(huán)境保護法律法規(guī)情況、完成自然資源資產(chǎn)管理和生態(tài)環(huán)境保護目標情況、履行自然資源資產(chǎn)管理和生態(tài)環(huán)境保護監(jiān)督責任情況;(6)自然資源資產(chǎn)和生態(tài)環(huán)境保護相關資金征管用和項目建設運行情況;(7)其他與自然資源資產(chǎn)管理和生態(tài)環(huán)境保護相關的事項。